BioSolveIT SeeSAR 3.2 药物结构改造软件

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BioSolveIT SeeSAR 3.2 药物结构改造软件
  • 软件作者: 网络搜集
  • 软件大小: 12 MB
  • 下载次数: | 所属栏目: 生物化学软件
  • 软件语言: 英文软件
  • 需要金币: 40 金币 金币充值金币
  • 软件评级: ★★★★★
  • 更新时间: 2015-08-12
  • 软件授权: 破解软件
  • 插件情况:
  • 运行环境: WinXP,Win7,Win8
SeeSAR是一个研究分子相互作用,可视化化合物优先次序和化合物结构改造的软件。在基于结构的药物设计中,同时考虑多参数的分子结构改造的成功率远高于只考虑亲和性的结构,而SeeSAR的一个优势就是能将已有的相关参数与实时3D可视化图形相结合。BiosolveIT团队着手探寻“提出和验证”这一新的化学信息学计算模式,结合已有的四项参数使SeeSAR能胜任相关研究,这四个参数分别是:
1. 亲和力:通过精致的图形可视化原子亲和力贡献,允许粗略估算ΔS /ΔH-自由能分裂。(由拜耳、汉堡大学和BioSolveIT共同持续开发)。
2. 物化性质:在整个设计过程中考虑实时计算相关或输入的参数。
3. 扭转-热:通过直观的颜色编码获得扭转统计分析(由罗氏公司和汉堡大学合作开发)。
4. 探索空间:亲和力和特异性的先决条件是紧密结合。因此,高效计算加上精确图形可提供结合界面及位置的动态可视 化图,指导用户以获得更紧密的结合方式。
 
优势:
1. SeeSAR操作简单,易于上手。
2. SeeSAR帮助化学工作者接触3D的构效关系和基于结构设计,这是成功设计药物分子的捷径。
3. SeeSAR帮助减少项目成本:a.指导用户一步一步改进设计;b. 提供即时结果;c. 简化报告生成。
4. SeeSAR揭示结构缺陷。如果它不能正确预测结果,用户会看到原因,使科研者专注于如何解决问题。
5. SeeSAR由德国科学家开发,基于可靠理论基础,非常稳健,能出色地完成药物分子结构优化任务。
BioSolveIT SeeSAR 3.2 药物结构改造软件

SeeSAR is a software tool for interactive, visual compound prioritization as well as compound evolution. Structure-based design work ideally supports a multi-parameter optimization to maximize the likelihood of success, rather than affinity alone. Having the relevant parameters at hand in combination with real-time visual computer assistance in 3D is one of the strengths of SeeSAR.

Stimulating exploration with SeeSAR, we have embarked on persuing a new cheminformatics compute paradigm of "Propose & Validate" with these first four themes accomplished so far: 
1. affinities:
We implemented sophisticated graphics to visualize atom-based affinity contributions; that allow for a rough estimate of the ΔS / ΔH -split of the Free Energy. (This is an ongoing co-development between BAYER, the University of Hamburg and BioSolveIT.) 
2. phys-chem properties:
Relevant parameters are computed on-the-fly or imported to be taken into consideration throughout the design process. 
3. torsional 'heat':
Torsional statistics analyses (developed between Hoffmann-LaRoche and the University of Hamburg); is readily available via intuitive color-coding. 
4. 'explorable space':
A tight fit is the prerequisite for both, affinity and specificity. Therefore, as guidance for the user, efficient computation combined with refined graphics provides on-the-fly visualization of gaps in the binding interface and positions where a tighter fit is likely to be gained.
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